هیدروسفالی به سیستم عصبی مغز کودکان که در حال رشد هستند، آسیب زده و باعث ایجاد مشکلات شناختی و ذهنی در کودکان می شود. از دیگر عوارض هیدروسفالی در کودکان می توان به موارد زیر اشاره کرد: اختلالات رشدی و حرکتی عدم تعادل و هماهنگی عضلات نوسانات خلقی و مشکلات رفتاری عقب ماندگی ذهنی