به دلیل ناهنجاری های شدید و صرع متوالی و غیر قابل کنترل، طول عمر نوزادان هیدروسفالی معمولا کوتاه است و ممکن است در همان سال اول بمیرند. اما برخی دیگر می توانند تا چند سال عمر کنند. به خصوص اگر به موقع این عارضه در آنها شناسایی و برای درمان آن اقدام شود.